按照常规计算方法，违约金应通过以下公式进行计算：
违约金额=本金×违约比例。
在此基础上，假设您所提到的情况中，本金共计13000元，违约比例为3%，则可以得出违约金的计算结果为：
违约金=13000×3%=390元。
然而需要明确指出的是，实际计算违约金时，还须参照双方签署的合同中所约定的违约金计算方式以及相关条款的详细内容。
若合同中有特别规定，如对违约金计算基数进行调整或设定其他限制条件等，这将有可能对最终的违约金数额产生影响。