手写协议书是具有法律效力的。
具体而言，需满足以下条件：
①双方需具备相应的民事行为能力。
比如，签订协议的双方必须是能够独立实施民事法律行为的自然人或法人，未成年人或精神病人等无民事行为能力或限制民事行为能力人，需在法定代理人同意或追认下签订协议。
②意思表示要真实。
即双方签订协议是出于真实意愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
③不能违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
手写协议书能清晰明确双方的权利和义务，是有效的契约形式。
在司法实践中，其与打印或其他形式的协议书法律效力等同。
为避免后续争议和纠纷，手写协议书要尽量字迹清晰，让人一目了然；
内容完整，涵盖必要条款；
条款明确，不产生歧义。
并且，需由双方签字或盖章确认。
同时，要妥善保存协议书原件及相关证据。
总之，手写协议书符合法律规定就有法律效力，但要留意相关细节和证据留存。

案情回顾:

小朱与小李签订了一份手写协议书，约定合作经营一家店铺。后因经营问题产生分歧，小朱主张协议无效，争议点在于小朱认为小李签字时存在胁迫情形，且协议部分条款可能违反行政法规强制性规定。

案情分析:

1、关于民事行为能力，小朱和小李均为成年人，具备相应民事行为能力，不存在无或限制民事行为能力情形。
2、对于意思表示真实方面，若小朱主张小李签字时受胁迫，需提供相应证据，若无证据，一般认定双方意思表示真实。
3、针对是否违反法律规定，若协议条款确违反行政法规强制性规定或公序良俗，则协议可能无效，需具体审查相关条款。