在房产交易等相关事务中，简单的房产协议经过公证后，通常是有效的，不过这需要满足一些特定条件。
下面为您详细介绍：
一、主体适格
协议的双方必须具备相应的民事行为能力。
这意味着签订协议的人要能够独立地进行民事活动，并且能够对自己的行为所产生的后果承担相应的责任。
例如，成年人一般具有完全民事行为能力，可以独立签订房产协议；而未成年人或者精神病人等可能不具备完全民事行为能力，他们签订的房产协议可能就会存在效力问题。
二、意思表示真实
双方签订房产协议必须是出于真实的意愿。
也就是说，不存在一方欺诈、胁迫另一方，或者乘人之危等导致意思表示不真实的情况。
比如，一方通过隐瞒房产的重大瑕疵来诱使另一方签订购买协议，这种情况下协议的效力就可能受到影响。
三、内容合法
房产协议的内容不能违反法律法规的强制性规定，也不能损害国家、集体或者第三人的利益。
例如，协议不能约定将违法建筑进行买卖，或者以损害他人利益为目的来处分房产。
公证的作用主要是增强协议的公信力和证明力。
经过公证的房产协议，在没有足够的相反证据来推翻的情况下，其真实性和合法性会得到更高程度的认可。
即使房产协议未经公证，只要满足上述有效条件，它本身也是有效的。
但考虑到房产涉及重大财产权益，进行公证能更好地保障当事人的权益。

案情回顾:

小朱欲出售房产给小李，双方签订房产协议并进行了公证。但后来小李发现该房产存在重大瑕疵，小朱在签订协议时故意隐瞒，小李认为协议无效，双方产生争议。

案情分析:

1、主体适格方面，若小朱和小李均为成年人且精神正常，具备相应民事行为能力，此条件满足。
2、意思表示真实方面，小朱隐瞒房产重大瑕疵诱使小李签订协议，存在欺诈行为，导致小李意思表示不真实，此情况可能影响协议效力。
3、内容合法方面，若房产本身不存在违法等问题，此条件或满足。但因存在欺诈，协议效力存疑。公证虽增强公信力，但不能改变存在欺诈的事实。