车库转让协议书的效力问题，需要依据具体情形来综合判断，以下为您详细阐述：
1.主体适格情况分析：
签订车库转让协议书的双方，必须具备相应的民事行为能力。
比如，完全民事行为能力人能够独立实施民事法律行为，其签订的协议在主体方面通常是有效的。
然而，若一方是无民事行为能力人，像不满八周岁的未成年人、不能辨认自己行为的八周岁以上的未成年人、不能辨认自己行为的成年人等，或者是限制民事行为能力人，如八周岁以上不满十八周岁的未成年人、不能完全辨认自己行为的成年人等，且未经法定代理人追认，那么这份协议就可能被认定为无效。
2.意思表示真实性探究：
协议必须是双方真实意愿的体现。
若在签订过程中，一方通过欺诈手段，故意告知对方虚假情况，或者隐瞒真实情况，诱使对方作出错误意思表示；或者采用胁迫手段，迫使对方违背真实意愿签订协议；又或者存在重大误解等情况，导致意思表示不真实，那么这样的协议效力就会受到影响。
3.内容合法与否判定：
-若车库拥有合法产权，且转让协议的各项内容都符合法律法规的规定，不存在违法违规条款，该协议是有效的。
-倘若车库属于人防工程等法律明确禁止转让的类型，即便双方签订了转让协议，该协议也可能因违反法律强制性规定而无效。
-要是转让的是仅有使用权的车库，协议中明确约定为使用权转让，并且不违反相关规定，这种情况下协议也是有效的。
综上所述，判断车库转让协议书的效力，需综合考虑多方面因素。

案情回顾:

小朱欲将自家车库转让给小李，双方签订了车库转让协议书。但小李后来得知该车库可能涉及人防工程，质疑协议效力。同时，小朱在签订协议时隐瞒了一些车库相关真实情况，小李认为自己受到欺诈。

案情分析:

1、主体适格方面，若小朱和小李均为完全民事行为能力人，在主体方面协议通常有效；若一方存在无或限制民事行为能力且未经追认，协议可能无效。
2、意思表示真实性上，小朱隐瞒真实情况，使小李作出错误意思表示，此协议效力会受影响。
3、内容合法判定中，若车库属人防工程，协议因违反强制性规定可能无效；若车库有合法产权且内容合法，协议一般有效。