通常来讲，合同发生变更后，原合同并不会自动失去效力。
倘若双方仅仅是对合同作出了变更操作，那么原合同在变更条款所限定的范围之内，其效力便会消失，而未被变更的部分依然继续有效。
变更之后的合同条款会替代原合同当中相应的条款，进而成为双方新的关于权利与义务的约定。
具体的处理方式如下：
其一，必须清晰地明确变更的具体内容以及范围，把变更条款以书面的形式详细地记录下来，并且要经过双方的签字或者盖章予以确认，使其成为合同整体的一部分。
这样可以避免后续可能出现的纠纷，明确双方的责任和义务。
其二，对于原合同当中已经履行完毕的部分，应当按照原合同所约定的内容进行处理；而对于变更之后尚未履行的部分，则按照变更后的合同约定来执行。
这样能够确保合同的履行过程有序进行，避免因合同变更而导致的混乱。
其三，如果双方在原合同的作废或者留存问题上存在争议，那么可以通过双方协商的方式来解决，也可以诉诸法律途径，由法院根据具体的情况进行判定。
总之，在合同变更之后，一定要妥善地处理原合同，通过上述一系列的措施，确保双方的权利和义务都能够得到明确的界定和有效的保障。

案情回顾:

小朱与小李签订了一份买卖合同。之后他们对合同进行了变更，但未书面记录变更内容且无双方签字盖章确认。在合同履行中，小朱认为原合同已失效，应完全按变更后的内容执行，小李则认为原合同部分有效。双方对原合同的效力及执行产生争议。

案情分析:

1、按照规定，合同变更需书面记录并双方签字盖章确认变更内容范围，他们未这样做导致争议。
2、原合同已履行部分应按原合同处理，未履行部分按变更后合同执行，但他们未明确，引发权利义务界定不清的问题。
3、对于原合同的处理方式双方有争议时，应协商或走法律途径解决，他们未协商或诉讼前就自行按各自想法执行。