互负债务的处理，常见有以下几种方式：
1.抵销：当双方所负债务的标的物，在种类和品质上相同，并且都已到了履行期限时，一方就能够把自己的债务和对方的债务进行抵销。
比如说，甲欠乙1000元货款，乙也欠甲1000元借款，这种情况下就可能适用抵销。
不过，要是依照法律规定，或者按照合同本身的性质，是不允许进行抵销的，那就不能采用这种方式。
2.提存：要是债权人没有正当理由，拒绝接受债务人履行债务，或者债权人的下落不明等，导致债务人没办法履行债务时，债务人可以把标的物进行提存，如此一来，债务也就随之消灭。
比如，债权人突然失联，债务人就可提存。
3.混同：当债权和债务最后归于同一个人时，合同的权利和义务就会终止。
但要是涉及到第三人利益的，就另当别论。
4.协商：双方可以就债务的履行方式、期限等进行商量，达成一致意见后，按照协商的结果来处理互负债务。
处理互负债务时，要结合具体情况选合适方式，并遵循法律规定。

案情回顾:

小朱和小李互负债务，小朱欠小李1万元货款，小李欠小朱1万元借款，均已到期。小朱想抵销债务，小李却称合同性质不允许抵销。后小朱送货给小李时，小李无故拒绝接受，小朱考虑提存。再后来小朱收购了小李公司，出现混同情况，但涉及第三人利益。双方还就债务协商但未达成一致。

案情分析:

1、对于抵销，若合同性质确实不允许，小朱不能强行抵销，需遵循相关规定。
2、小李无故拒绝接受货物，小朱提存符合条件，提存后债务可消灭。
3、虽出现混同，但涉及第三人利益时，不能简单终止权利义务。
4、协商未达成一致，双方应继续寻找合适处理方式。