医疗事故纠纷部门不管的，可以到卫生局投诉，也可以到法院起诉。
根据医疗事故处理条例的有关规定，一旦发生医疗纠纷，医患双方可自行协商，也可以向卫生行政部门提出处理申请，还可以向人民法院提起诉讼，如果医疗纠纷涉及患者的人身损害，那么患者还可以提起技术鉴定。
《医疗纠纷预防和处理条例》第二十二条规定，发生医疗纠纷，医患双方可以通过下列途径解决：
(一)双方自愿协商；
(二)申请人民调解；
(三)申请行政调解；
(四)向人民法院提起诉讼；
(五)法律、法规规定的其他途径。