外地就医的农村合作医疗在参合地医保申请批准后可以报销。在外地住院就医时，需要先向参合地医保提出申请，批准了以后可以报销，否则参合地是不给报销的。
参保地批准以后带上住院的病历、住院的发票、费用清单、疾病诊断书、出院的小结、身份证、户口本和合作医疗本及转院的手续这些资料到指定的报销医院的医保结算窗口进行报销。

《中华人民共和国社会保险法》第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。