医疗事故鉴定程序是这样的：一开始，当患者遇到医疗事故争议时，需向医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门提出处理申请。
卫生行政部门收到这一申请后，会对其进行审核，只要符合受理的条件，就会予以受理。
接着，卫生行政部门会及时通知医疗事故争议的双方当事人，让他们提交进行医疗事故技术鉴定所需要的各种材料。
随后，医学会会组织专家鉴定组，严格依照相关的规定以及程序来开展医疗事故技术鉴定工作。
在鉴定过程中，专家鉴定组会全面、综合地分析医疗过失行为在导致医疗事故损害后果中所起的作用，同时也会考虑患者原有的疾病状况等多方面的因素，然后作出诸如医疗事故等级、责任程度等一系列的鉴定结论。
通常情况下，医学会会在受理申请后的45日内出具鉴定书；
但如果遇到特殊情况，比如鉴定过程中需要进一步调查核实某些关键信息等，鉴定时间就可以适当延长30日。