按照下列程序进行医疗纠纷鉴定：
1.司法鉴定机构收到委托书后，应对委托人的委托事项进行审核，作出是否受理的决定。
2.鉴定机构受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行。
3.需要补充鉴定的，司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定，应当对委托人请求的事项进行审查，不属的情形，社会专业司法鉴定机构应当向委托人说明情况，并退回委托书。
4.对鉴定结论有异议需进行复核鉴定的，其他资质较高的司法鉴定机构可以接受委托，进行复核鉴定。
5.司法鉴定人完成社会专业司法鉴定工作后，应当出具司法鉴定文书。

《刑事诉讼司法解释》第八十四条
对鉴定意见应当着重审查以下内容：(一)鉴定机构和鉴定人是否具有法定资质;(二)鉴定人是否存在应当回避的情形;(三)检材的来源、取得、保管、送检是否符合法律、有关规定，与相关提取笔录、扣押物品清单等记载的内容是否相符，检材是否充足、可靠;(四)鉴定意见的形式要件是否完备，是否注明提起鉴定的事由、鉴定委托人、鉴定机构、鉴定要求、鉴定过程、鉴定方法、鉴定日期等相关内容，是否由鉴定机构加盖司法鉴定专用章并由鉴定人签名、盖章;(五)鉴定程序是否符合法律、有关规定;(六)鉴定的过程和方法是否符合相关专业的规范要求;(七)鉴定意见是否明确;(八)鉴定意见与案件待证事实有无关联;(九)鉴定意见与勘验、检查笔录及相关照片等其他证据是否矛盾;(十)鉴定意见是否依法及时告知相关人员，当事人对鉴定意见有无异议。