医疗事故主要是由卫生行政部门来管理的。
卫生行政部门，就像是一个大管家，专门负责盯着医疗机构以及里面的医务人员的医疗服务行为，得好好监督管理着，要是出现了医疗事故，那它就得去调查、认定并且处理。
具体到实际情况，县级以上地方的人民政府卫生行政部门，就负责管理本行政区域内的医疗机构。
要是真的发生了医疗事故，患者或者患者的家属就可以向卫生行政部门提交医疗事故争议处理的申请，然后卫生行政部门就会按照法律规定去进行调查、处理，这里面包括组织专家来进行鉴定，然后作出处理决定之类的。
另外，司法机关在医疗事故相关的法律诉讼中那可是有着很重要的作用，就比如说法院，它会对医疗事故赔偿之类的民事纠纷进行审理和裁决，确保各方的合法权益都能得到保障。