1）在理赔方式上不同：
重疾险是给付；
百万医疗险是报销；
2）保障期限不同：
重疾险可以是一年期、保20年、保障到70周岁或终身，其中任一都是可以的；
百万医疗险是交一年保一年的；
3）投保年龄限制不同：
重疾险的投保年龄限制较严格，基本超过55周岁/60周岁就没有什么重疾险可以选择了；
但百万医疗险的投保年龄限制就比较宽松了，超过55周岁依然有很多产品可选择。
4）保障范围不同：
重疾险可提供的是重疾、轻症、部分产品有中症的保障；
医疗险的保障范围比较广，不仅是疾病还会包括护理、检查和床位等费用。
5）保障额度不同：
大多数的重疾险的保险金额从10万、20万到50万不等。

《中华人民共和国社会保险法》第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。