下列情形应吊销食品许可证：
1、经营病死、毒死或者死因不明的禽、畜、兽、水产动物肉类，或者生产经营其制品；
2、用非食品原料生产食品、在食品中添加食品添加剂以外的化学物质和其他可能危害人体健康的物质；
3、生产经营营养成分不符合食品安全标准的专供婴幼儿和其他特定人群的主辅食品。

《食品流通许可证管理办法》第三十六条
食品经营者在营业执照有效期内被依法注销、撤销、吊销食品流通许可，或者《食品流通许可证》有效期届满的，应当在注销、撤销、吊销许可或者许可证有效期届满之日起三十日内申请变更登记或者办理注销登记。