医院鉴定残疾等级及收费通常按以下步骤进行：
一、身体检查与评估
相关科室医生会对患者展开全面身体检查和评估。
这包括详细询问病史，了解残疾发生的原因、过程等；
对身体各部位进行细致检查，像肢体的运动功能、感觉功能，以及内脏器官的功能状况等，以此明确患者的残疾情况和功能障碍程度。
二、指标量化评定
依据如《残疾人残疾分类和分级》等评定标准，对各项指标进行量化评定。
例如，肢体残疾会根据肢体活动受限的范围、程度等确定等级。
三、辅助检查及费用
鉴定可能涉及影像学检查等辅助检查，费用需另行支付。
如骨折后的残疾鉴定，可能需拍X光片查看骨骼愈合情况。
四、收取鉴定费用
医院按规定收费，费用因地区和医院而异，一般数百元到上千元不等。
不同残疾鉴定要求和流程不同，部分需到专门机构鉴定。
有疑问可咨询医保部门或医院相关科室。

案情回顾:

小朱因工伤导致肢体受伤，前往医院进行残疾等级鉴定。医院进行身体检查与评估后，在指标量化评定环节，小朱认为评定标准适用有误。且对于辅助检查费用需另行支付有异议，同时觉得鉴定费用过高。

案情分析:

1、关于评定标准适用问题，医院应严格依据如《残疾人残疾分类和分级》等标准进行量化评定，若小朱认为有误，可要求医院出示评定依据和解释。
2、辅助检查费用另行支付符合一般规定，因为此类检查并非鉴定费用涵盖范围，旨在更准确判断残疾情况。
3、鉴定费用因地区和医院而异，若小朱认为过高，可咨询医保部门或其他相关科室了解收费合理性。