对于受害者因自我保护措施导致其轻伤害层次的损伤情况下，是否应该进行赔偿，这主要取决于自我保护行为在法律意义上是否被认定为正当防卫行为。
如果这个行为符合法律规定的正当性条件，那么就不需要进行任何形式的赔偿，但如果实施的保护措施超过了法律规定的必要限度，那么当事人将需承担相应的民事赔偿责任。
需要赔偿的金额通常包含了医疗费用、看护费用、交通费用、饮食营养费用、医院住院伙食补助费用等等这些为了治疗和恢复健康而产生的合理开支，以及因为错过工作从而减少的收入部分。
当具体涉及到如何计算赔偿金额时，就必须参考实际产生的所有费用，结合对方受到的伤害程度以及我们和对方各自存在的错误行为情况进行综合性的评估和决定。
我建议您尽全力去搜集并妥善保管与自我保护行为有关的所有证据，这样在未来可能发生的法律程序中可以更有力地证明您所采取行动的合法性。
在此基础上，您还可以尝试与对方进行友好的赔偿协商，如果无法达成共识，那么可能会面临民事诉讼的风险。