在抚养权协议中明确约定抚养权归男方的情况下，若女方不履行该协议，可参考以下方式妥善处理：
一、协商解决
当遇到女方不履行协议的情况时，男方首先应当尝试与女方进行友好协商。
在协商过程中，男方要清晰、明确地向女方指出，她不履行协议的行为已经违背了当初双方的约定。
同时，详细说明按照协议，她有责任和义务将孩子交由男方抚养。
通过平和、理性的沟通，双方有可能充分理解彼此的立场和需求，从而找到解决问题的方法，避免矛盾进一步激化，引发更复杂的纠纷。
二、申请调解
如果协商未能取得理想的结果，男方可以向相关的调解组织提出调解申请，这些调解组织作为中立的第三方，会秉持公正、客观的态度介入此事。
调解人员会分别与双方进行深入沟通，了解事情的来龙去脉，依据相关法律和情理，努力促使双方达成一致的解决方案。
三、提起诉讼
若调解也无法解决问题，男方可以依法向法院提起诉讼。
在诉讼过程中，男方需向法院提供充分的证据，要求法院确认抚养权协议的法律效力，并判令女方按照协议履行义务，将孩子的抚养权交付给男方。
法院会根据具体的事实情况以及相关的法律规定作出公正的判决。
若女方在判决生效后仍然拒不履行，男方有权申请法院强制执行，以维护自身的合法权益。

案情回顾:

小朱与小丽签订抚养权协议约定抚养权归小朱，但小丽不履行协议。小朱先尝试协商，指出小丽违约，要求其按协议交孩子给自己抚养；协商无果后申请调解；调解不成，小朱提起诉讼，要求确认协议效力，让小丽履行义务，争议点在于小丽拒绝按协议交付抚养权。

案情分析:

1、小朱与小丽协商时，明确指出小丽违约行为，这是合理维权的第一步，旨在通过沟通和平解决纠纷，避免矛盾升级。
2、申请调解是借助中立第三方力量，调解组织会客观公正介入，促使双方达成解决方案，这是一种较为温和且有效的解决途径。
3、提起诉讼是最后的法律手段，小朱提供证据要求确认协议效力，若小丽仍不履行生效判决，小朱申请强制执行能有效维护自身权益。