1.当两个儿子都还没到两周岁这个年龄的时候，通常情况下是跟着母亲生活的。
不过，如果母亲出现了以下这些情况，那就可以跟着父亲生活：要是母亲患有那种怎么治疗都好不了的传染性疾病，或者是其他特别严重的疾病，这种情况下孩子不太适合和她一起生活；还有就是母亲明明有抚养孩子的条件，却不履行抚养的义务，而父亲又要求孩子跟着他生活；另外，因为其他一些原因，导致孩子确实没有办法跟着母亲生活。
2.要是孩子已经超过两周岁了，父母双方在抚养问题上没办法达成一致意见，那么就由人民法院根据父母双方的具体情况来进行判断。
法院会按照最有利于未成年子女的原则来作出判决，这里的具体情况包括父母的经济状况、工作性质、居住环境等等各个方面。
3.当孩子到了八周岁以上的时候，就一定要尊重孩子自己的真实意愿。
不管是判决跟着父亲还是母亲生活，都要充分考虑孩子自己的想法和感受。
总之，法院在作出判决的时候，会把父母双方的抚养能力、抚养条件以及孩子的意愿等这些因素都综合起来考虑，这样才能更好地保障孩子的合法权益。

案情回顾:

小朱和小李离婚，育有二子均未满两周岁。小朱患有难以治愈的传染病，小李要求孩子随其生活，小朱不同意。孩子超过两周岁后，双方仍对抚养问题存争议。孩子八周岁后，在抚养权判决时，孩子表示愿随小李生活，小朱对此有异议。

案情分析:

1、孩子未满两周岁时，小朱患有难以治愈的传染病，根据相关规定，这种情况下孩子不适宜与母亲生活，小李要求孩子随其生活合理。
2、孩子超过两周岁，双方无法达成一致意见，法院应综合父母经济状况、工作性质等具体情况，按最有利于未成年子女原则判决。
3、孩子八周岁以上，应尊重其真实意愿，孩子愿随小李生活，法院判决时应充分考虑此因素。