关于婚后有两个孩子的离婚判决，通常会遵循一定的原则，以下为你详细介绍：
一、两周岁以下子女的判决情况
一般而言，两周岁以下的子女会随母方生活。
这是因为在这个阶段，孩子通常更需要母亲的照料和关爱。
然而，若母方存在一些不适宜抚养孩子的情形，比如患有久治不愈的传染性疾病，或者存在其他严重影响孩子身心健康的状况，那么孩子可能就不会判给母方。
例如，母亲患有严重的传染病且具有较强传染性，孩子跟随母亲生活可能会面临被感染的风险，这种情况下法院可能会考虑其他抚养安排。
二、两周岁以上子女的判决考量
对于两周岁以上的子女，法院在判决抚养权时会综合多方面因素。
其中包括双方的抚养能力和抚养条件等。
比如，一方有稳定且较高的收入，能够为孩子提供良好的物质生活；拥有稳定、适宜孩子居住的环境等，这些更有利于孩子成长的条件，会使该方在争取抚养权时更具优势。
三、八周岁以上子女尊重其意愿
八周岁以上的子女，法院会尊重他们的真实意愿。
因为这个年龄段的孩子已经有了一定的认知和判断能力，能够表达自己的想法和需求。
四、总体分配及抚养费问题
通常，法院可能会判决一方抚养一个孩子，但并非绝对。
若一方存在严重不利于孩子身心健康的情形，如虐待、遗弃等，另一方则可能获得两个孩子的抚养权。
同时，不直接抚养孩子的一方需支付抚养费，数额会根据孩子实际需要、双方经济状况等确定。

案情回顾:

小朱和小李婚后育有两个孩子，大孩子已九岁，小孩子一岁。后两人感情破裂闹离婚，争议焦点在于孩子抚养权归属及抚养费问题。小朱收入高且居住环境好，小李却查出患有传染性疾病。大孩子表示愿随小朱生活。

案情分析:

1、对于一岁的小孩子，按原则通常应随母方生活，但小李患有传染性疾病，可能影响孩子身心健康，这种情况下小朱获得小孩子抚养权的可能性较大。
2、九岁大孩子已达八周岁以上，法院会尊重其意愿，其表示愿随小朱生活，所以大孩子抚养权大概率判给小朱。
3、若小朱获得两个孩子抚养权，小李作为不直接抚养方，需支付抚养费，数额会综合孩子实际需要及双方经济状况等来确定。