公证书的保存问题，需依据不同情形具体分析，以下为您详细阐述：
1.自行保存：
公证书作为具备法律效力的重要证明文件，当事人自然有权利自行保存。
在实际生活中，存在诸多情况使得当事人后续可能需要查阅公证书内容以证实相关事实。
例如在房产继承方面，当涉及房产继承的公证书出具后，日后办理房产过户手续时，相关部门会要求提供该公证书，以此来确认继承的合法性和真实性。
再比如，在一些民事纠纷的处理过程中，公证书也可作为关键证据来支撑自己的主张。
所以，当事人自行妥善保存公证书，能够在需要时方便快捷地使用，避免因找不到公证书而带来不必要的麻烦。
2.按要求提交或存档：
部分公证书需要根据具体事项的要求，提交给特定的部门或机构。
以商业交易为例，在一些涉及金额较大、风险较高的商业活动中，为确保交易的合规性和真实性，相关的公证书可能需要提交给监管部门，以便其进行监督和管理。
同时，交易对方也可能要求提供公证书作为交易的必要证明材料。
相关部门在收到公证书后，会按照规定进行存档，以便日后查询和管理。
综上所述，公证书通常情况下当事人可自行保存，但如果特定事项明确要求提交给特定主体，就应当按照要求及时办理相关手续。

案情回顾:

小朱办理了一份房产继承公证书后自行保存。之后办理房产过户时，相关部门要求其提供公证书以确认继承合法性。而小李在商业交易中，监管部门和交易对方都要求其提交相关公证书存档。争议点在于公证书是自行保存还是按要求提交存档。

案情分析:

1、小朱的房产继承公证书自行保存，在办理房产过户时能及时提供，符合公证书当事人有自行保存权利的规定，方便其证实相关事实，避免后续麻烦。
2、小李商业交易中的公证书按要求提交给监管部门和交易对方存档，是因为特定商业活动需要确保交易合规性和真实性，相关主体有存档管理的必要。