在婚姻生活中，分居六年且妻子出轨并怀孕，这是一种较为复杂且严重的情况。
从法律角度来看，我国法律明确规定，当夫妻因感情不和而分居满两年时，其中一方起诉离婚，即便经过调解仍无效，就应当准予离婚。
妻子的出轨怀孕行为，属于婚姻中的重大过错情形。
在离婚诉讼过程中，这一因素可以被视为认定夫妻感情是否破裂的重要依据之一。
然而，不能仅仅因为这一情况就直接判决离婚，法院需要综合考虑诸多因素。
比如，要考量双方之前的感情基础是否深厚，这关系到离婚是否是双方共同的意愿，还是一方的执意行为。
还要考虑过错的程度，出轨怀孕的过错相对较大，但也需要综合其他方面来评判。
同时，子女抚养问题也是一个关键因素，若有子女，需考虑孩子的利益和成长环境等。
只有当一方坚决要求离婚，并且有充分的证据能够确凿证明夫妻感情确已破裂时，法院一般才会作出判决离婚的决定。
这体现了法律在处理婚姻案件时的严谨性和公正性，既要维护婚姻的稳定性，也要保障当事人的合法权益。