要是因为感情方面不和睦，然后分居已经满了两年嘞，就算经过法院去调解，也没啥效果，这种情况下，一般是应该准许离婚的。
当第二次起诉离婚的时候，如果能够拿出足够多的证据来证明分居确实已经满了两年这个事实，并且法院也认定夫妻之间的感情确实已经破裂，那通常就会做出判决离婚的决定。
不过，法院判决离婚这件事，得综合好多方面的因素去考虑，像婚姻一开始的基础咋样，婚后夫妻之间的感情又咋样，还有导致离婚的原因是啥等等这些方面。
要是对方特别坚决地不同意离婚，但是，又还有和好的可能，那法院也有可能就判决不离婚。
所以说，仅仅只是分居两年以上然后第二次起诉，这可不一定就肯定会判决离婚，得看具体的案件情况到底是啥样的。