如果在农村有房但没有房产证，并且想要新建房子，可参照以下详细步骤来操作：
1.明确无证具体原因：
农村房屋无证的情况较为复杂，原因多种多样。
一方面，可能是历史遗留问题导致的。
在过去，建房审批制度或许还不够完善，很多地方对于建房的管理没有如今这么规范和细致。
例如，当时可能只需要简单的口头申请或者没有明确要求办理一系列复杂的手续就能建房。
另一方面，也有可能是建房时房主自身未按照规定去办理相关手续，比如没有提交建房申请、缺少必要的土地使用证明等。
2.积极补办相关证件：
如果是历史遗留问题造成的无证情况，房主可以主动向当地村委会、乡镇政府等有关部门咨询补办房产证的具体流程和要求。
一般来说，需要准备好土地来源证明，用以证实建房土地的合法性，还需要提供建房申请等一系列材料，然后按照既定程序申请补办证件。
3.依规申请新建房屋：
在完成补办手续或者确定能够办理相关证件之后，要向村委会提出新建房屋的申请。
待村委会同意后，再报乡镇政府进行审批。
要是涉及到农用地转用等特殊情况，还需要经过相关部门的进一步审批。
只有在顺利通过所有审批环节后，才可以按照规定开始建设新房。

案情回顾:

小朱在农村有房但没房产证，想新建房子。争议点在于其房屋无证原因不明，且新建房屋审批流程复杂。小朱先着手明确无证原因，后补办相关证件，再依规申请新建，过程中村委会和乡镇政府的审批态度成关键。

案情分析:

1、关于无证原因，若因历史遗留问题，相关部门应考虑当时实际情况，合理指导小朱补办。若因自身未按规定办理，小朱需承担相应责任并积极补救。
2、补办证件环节，小朱需按要求准备材料，如土地来源证明等，确保材料真实有效，以便顺利补办。
3、申请新建时，村委会和乡镇政府应严格依规审批，涉及农用地转用等特殊情况，相关部门更要谨慎审查，保障新建房屋合法合规。