当盖房子与邻居发生纠纷时，可通过以下途径妥善解决：
1.协商解决
这是解决纠纷最为经济、高效的方式。
双方当事人应心平气和地直接就争议问题展开深入沟通和协商。
比如，若是因为建房占地边界问题起了争执，双方可以一起到现场，对照相关证件和历史情况，清楚地表明各自的想法和诉求。
在沟通中，充分考虑彼此的利益和实际困难，尝试寻求一个双方都能接受、达成一致的解决方案。
如此一来，不仅能有效解决问题，还能维持良好的邻里关系。
2.调解
可请求村民委员会、居民委员会等基层组织或者专业的调解机构介入调解。
调解人员会深入了解纠纷的具体情况，包括纠纷产生的原因、双方的立场等。
比如在一些建房采光纠纷中，调解人员会实地查看房屋布局和采光状况，依据相关规定和实际情况，耐心地给双方分析利弊，促使双方达成和解协议。
3.行政处理
若纠纷涉及土地使用、规划等方面，可向当地的土地管理部门、城乡规划部门等相关行政机关反映。
相关部门会依法进行调查和处理，作出公正的处理决定。
4.诉讼解决
若前面的方式都无法解决纠纷，当事人可向人民法院提起民事诉讼。
诉讼过程中，要准备好充分的相关证据来支持自己的主张，比如建房审批手续、相关证人证言等，最终由法院依法作出判决。

案情回顾:

小朱盖房子时与邻居小李因占地边界问题发生纠纷。小朱认为按自家证件边界建房合理，小李却称小朱建房占了他家地。双方起初协商，各执一词未达成一致；后找村委会调解，也未成功；小朱向土地管理部门反映，处理结果小李不认可，纠纷仍未解决。

案情分析:

1、协商阶段，双方未能充分考虑彼此利益和实际困难，仅坚持自身诉求，导致无法达成一致解决方案。
2、调解阶段，可能因双方矛盾较深，调解人员虽实地了解情况并分析利弊，但未能促使双方和解。
3、行政处理阶段，小李不认可处理结果，说明可能存在对相关规定理解不一致的情况。
4、此时若诉讼解决，双方需准备好如建房审批手续等证据，以便法院公正判决。