当农村自建房施工遭遇邻居阻挡时，首先要做的是与邻居进行友好的沟通交流。
大家坐下来，心平气和地谈论各自的想法和需求，明确双方在这一过程中的权利与义务，努力尝试解决眼前的纠纷。
（序号1）
倘若友好协商未能达成一致，就可以向村集体组织，也就是村委会反映实际情况。
村委会作为村集体的管理机构，应当依据相关的法律法规以及村规民约来进行调解工作。
他们会充分考虑双方的立场和实际情况，积极促成双方达成和解，让自建房施工能够顺利进行。
（序号2）
要是调解依然没有效果，那么就可以向乡镇人民政府申请处理。
乡镇人民政府会对双方的争议进行详细的调查核实，通过严谨的法律程序和依据法律规定作出处理决定。
如果对这个处理决定不满意，在规定的期限内，既可以向上一级人民政府申请行政复议，也可以向人民法院提起行政诉讼，通过合法的途径来维护自己的合法权益。
（序号3）
在整个过程中，保留好相关证据是非常重要的，这些证据能够为后续的处理和维权提供有力的支持，确保自身的合法权益得到切实的保障。
（序号4）
案情回顾:

小朱打算在农村自家宅基地建房，施工时遭到邻居小李阻挡。小朱先与小李沟通，未达成一致。后向村委会反映，村委会调解也无果，小朱向乡镇政府申请处理，对处理决定不满，争议点在于小朱认为处理结果未充分保障其建房权益。

案情分析:

1、小朱与小李最初沟通未成功，表明双方对建房一事存在利益分歧，未能明确彼此权利义务。
2、村委会调解失败，可能是因双方分歧较大，村规民约难以平衡双方利益。
3、小朱对乡镇政府处理决定不满，有权在规定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。
4、小朱应保留好施工许可、沟通记录等证据，为维权提供支持。