借名买房的协议是不可以公证的。房屋产权是以房产证上的登记为准的,由于私下签订的协议效力难以确定,即使做了这类公证,在法律上也是无效的。如果双方因为借名买房产生纠纷的，可以通过以下方式维权：
1.双方协商一致的，可向登记机构申请异议登记。
利害关系人可向记名产权人请求协助办理变更登记手续。如果对方同意更正，则问题通过私力救济得以解决。如不同意，则利害关系人可以寻求公力救济。
2.可向法院请求确认其为所有权人。
因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。据此可知，利害关系人可向法院请求确认其为所有权人，即行使确认物权请求权。
3.可依据法院确认其为所有权人的判决请求登记机关变更登记。
如法院最终确认利害关系人为所有权人，该判决则属于“有证据证明登记确有错误”，登记机构应当予以变更登记。

《公证法》第二条
公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。