差异表现如下：
首先，二者所依循的法律法规有所不同。
国有独资企业需遵守《中华人民共和国全民所有制工业企业法》的相关规定，而国有独资公司则受《中华人民共和国公司法》的监管与规范。
其次，在管理体系层面，两者也存在显著差别。
国有独资企业的资本来源于国家财政，其运行方式采用政府任命或者员工选举后经过政府核准的厂长（总经理）负责制；相对来说，国有独资公司则以“归属清晰、权责明确、保护严格、流转顺畅”的现代产权制度作为导向，以期实现高效运作和可持续发展目标。

《公司法》第一百六十八条
国家出资公司的组织机构，适用本章规定；本章没有规定的，适用本法其他规定。
本法所称国家出资公司，是指国家出资的国有独资公司、国有资本控股公司，包括国家出资的有限责任公司、股份有限公司。