在商业运营中，欠债公司确实有权申请破产保护。
在公司因无法偿还即将到期的债务，且其资产不足以支付所有债务或其还债能力被明确认为不足的情况下，该公司便可依法申请破产。
值得注意的是，即便存在欠税问题，公司仍有权利申请破产。
然而，即使公司选择申请破产，其仍然必须履行缴纳所欠税款的义务。
在公司申请破产之后，将由破产清算小组负责对公司进行清算，包括清理和结算所有未付税款以及清算过程中所产生的税款。

《公司法》第一百八十四条
清算组在清算期间行使下列职权：
（一）清理公司财产，分别编制资产负债表和财产清单；
（二）通知、公告债权人；
（三）处理与清算有关的公司未了结的业务；
（四）清缴所欠税款以及清算过程中产生的税款；
（五）清理债权、债务；
（六）处理公司清偿债务后的剩余财产；
（七）代表公司参与民事诉讼活动。