以虚假文件设立公司的由工商管理部门撤销公司登记。

《中华人民共和国公司法》第一百九十八条：
违反本法规定，虚报注册资本、提交虚假材料或者采取其他欺诈手段隐瞒重要事实取得公司登记的，由公司登记机关责令改正，对虚报注册资本的公司，处以虚报注册资本金额百分之五以上百分之十五以下的罚款；
对提交虚假材料或者采取其他欺诈手段隐瞒重要事实的公司，处以五万元以上五十万元以下的罚款；
情节严重的，撤销公司登记或者吊销营业执照。