公司注销股东会决议的情形有：股东会决议的内容违法的；决议的召集或者表决程序违法的；决议的内容违反公司章程的。但是只有在法院确认股东会决议或者撤销决议后，公司才能依法注销股东会决议。公司股东会或者股东大会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。

《中华人民共和国公司法》第二十二条
公司股东会或者股东大会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。股东会或者股东大会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东可以自决议作出之日起六十日内，请求人民法院撤销。股东依照前款规定提起诉讼的，人民法院可以应公司的请求，要求股东提供相应担保。公司根据股东会或者股东大会、董事会决议已办理变更登记的，人民法院宣告该决议无效或者撤销该决议后，公司应当向公司登记机关申请撤销变更登记。