对于已经成立的变造公司债券罪是否应当得到应有的惩罚？答案是肯定的。
具体而言，当被告人犯下此罪时，将会面临以下惩处：
首先，若其涉案情节轻微，仅涉及少量公司债券被变造，那么他将被判处三年以下的有期徒刑，同时还要向国家支付罚款，罚款金额在人民币1到10万元之间；
其次，若被告人变造公司债券的数额较大，则其将可能面临更长的监禁时间（最高可达十年）以及更高的罚款（最高罚金为2到20万元）；
最后，倘若该行为并非由个人所为，而是整个单位参与其中，此时他们将面临双重处罚，个人将面临法律诉讼，而单位则需向国家缴纳罚款，同时对该单位的直接责任人也将依据普通个人犯罪法规予以惩罚。

《刑法》第一百七十八条
伪造、变造股票或者公司、企业债券，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。
单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。