应当运用证据证明的案件事实包括：
被告人、被害人的身份被指控的犯罪是否存在；被指控的犯罪是否为被告人所实施；被告人有无刑事责任能力，有无罪过，实施犯罪的动机、目的；实施犯罪的时间、地点、手段、后果以及案件起因等；有关管辖、回避、延期审理等的程序事实；与定罪量刑有关的其他事实。

《最高人民法院关于适用中华人民共和国刑事诉讼法的解释》第七十二条
应当运用证据证明的案件事实包括：
（一）被告人、被害人的身份；
（二）被指控的犯罪是否存在；
（三）被指控的犯罪是否为被告人所实施；
（四）被告人有无刑事责任能力，有无罪过，实施犯罪的动机、目的；
（五）实施犯罪的时间、地点、手段、后果以及案件起因等；
（六）是否系共同犯罪或者犯罪事实存在关联，以及被告人在犯罪中的地位、作用；
（七）被告人有无从重、从轻、减轻、免除处罚情节；
（八）有关涉案财物处理的事实；
（九）有关附带民事诉讼的事实；
（十）有关管辖、回避、延期审理等的程序事实；
（十一）与定罪量刑有关的其他事实。