依据我国《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关条款，当人民检察院对犯罪嫌疑人涉嫌的犯罪事实进行深入调查，收集到了切实可靠且充分的证据，并且认定其行为已构成刑事犯罪，依法应予追究法律责任之时，他们有义务作出起诉决定，并向当地人民法院提交公诉书。这就意味着，即便犯罪嫌疑人已经退还了赃款，只要犯罪事实清楚，证据确凿，且满足上述起诉条件，人民检察院依然有权提起公诉。退赃行为可以视为犯罪嫌疑人的一种悔过表现，在量刑过程中，可能会被作为从轻或减轻处罚的重要因素加以考虑，然而，这并不影响起诉决定的最终做出。因此，犯罪嫌疑人在退还赃款之后，仍然存在着被起诉的可能性。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十六条人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送人民法院。
犯罪嫌疑人认罪认罚的，人民检察院应当就主刑、附加刑、是否适用缓刑等提出量刑建议，并随案移送认罪认罚具结书等材料。”