在司法实践中，主犯不归案时能否结案是一个较为复杂的问题。
一般来说，仅当其他从犯的犯罪事实清楚、证据确凿，且能够认定其犯罪行为的性质、情节等达到了法定的定罪标准时，是可以根据从犯的情况进行结案的。
然而，如果主犯的行为对于整个案件的定性和量刑具有关键作用，且其不归案会影响到对其他犯罪嫌疑人的定罪量刑公正性，那么通常情况下是不能轻易结案的。
司法机关会持续对主犯进行追捕，以确保案件的完整性和公正性。
例如，在一些重大的经济犯罪案件中，主犯往往掌握着关键的证据和信息，其不归案可能导致整个案件的调查无法深入进行，无法全面还原犯罪事实。
在这种情况下，司法机关会通过各种手段，如发布通缉令、加强侦查等，努力将主犯缉拿归案，以保障法律的公正实施和社会的公平正义。
总之，主犯不归案能否结案要根据具体案件的情况来综合判断。