1、侵犯的客体和犯罪对象不同：
挪用资金罪侵犯的客体是公司、企业或者其他单位的资金的使用权，对象是公司、企业或者其他单位的资金，其中，既包括国有或者集体所有的资金，也包括公民个人所有、外商所有的资金。
挪用公款罪侵犯的客体是公款的使用权和国家机关的威信、国家机关的正常活动等，既有侵犯财产的性质，又有严重的渎职的性质。
挪用公款罪侵犯的对象限于公款，其中主要是国有财产和国家投资、参股的单位财产，即国家机关、国有公司、企业、事业单位等所有的款项。
2、挪用公款罪和挪用资金罪侵犯的对象客体不同，社会危害性程度也有较大的差别。
3、犯罪主体不同：
挪用资金罪的主体是公司、企业或者其他单位的工作人员，但国家工作人员除外。
挪用公款罪的主体是国家工作人员。

《刑法》第二百七十二条
公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，处三年以下有期徒刑或者拘役；
挪用本单位资金数额巨大的，或者数额较大不退还的，处三年以上十年以下有期徒刑。