按照《中华人民共和国刑法》之相关条款规定，强奸罪乃由法律明确规制，以暴力胁迫或其他不当方式侵害女性人身权利的犯罪行径。
在此所称的“女性个体”往往特指拥有生理女性特征的自然人。
若该男性经过变性手术后，其女性特征须具备概括性，则从法理层面考量，其或可被视作女性个体。
然而，对于此类案件是否构成强奸罪行，需结合具体案情慎重斟酌，纳入衡量因素包括该变性者的生理性别状况、受害者真实意愿、行施方的实际行为手段等等。
若变性者采取欺骗、隐匿等手段令受害者误认对方为女性并进而与之发生性关系，而受害者确有拒绝意愿，那么大概率将构成独立的强奸罪。
实际案件审理过程中，法院必然依据每个具体案件的事实情况及相关证据，谨慎裁判其是否构成强奸罪。
若变性者能有效举证证实受害者对与其发生性关系之行为表示同意，且不涉及任何形式的诈骗、强迫等违法手段，便可能不构成独立的强奸罪。
总的来说，判断某特定案件是否构成强奸罪行，需依具体案情逐一分析，尚无简单明了的定论。
如变性者通过非法手段导致受害者违背本意与其进行性行为，即很可能构成独立的强奸罪；
反之，若变性者能充分证明受害者对其行为表示同意且杜绝一切涉及强迫的违法手段，那么独立的强奸罪或可避免。

《中华人民共和国刑法》第二百三十六条
以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。
奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；
（四）二人以上轮奸的；
（五）奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；
（六）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。