依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百零二条的明文规定，人民法院在关键时刻，具有权力采取必要的保全措施，其中包括查封、扣押或冻结被告方的财产。换句话说，倘若某起案件以强奸罪名被正式立案调查，那么，只要人民法院认为该行为符合保全条件，即可有权冻结被告方的银行账户。这样做的目的在于确保案件得以顺利进行，并防止被告方试图通过转移资产等方式逃避法律责任，以便于接下来的民事赔偿以及判决的执行。因此，在强奸罪立案之后，被告方的银行账户确实存在着被冻结的可能性。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百零二条
人民法院在必要的时候，可以采取保全措施，查封、扣押或者冻结被告人的财产。附带民事诉讼原告人或者人民检察院可以申请人民法院采取保全措施。人民法院采取保全措施，适用民事诉讼法的有关规定。