关于协议搬迁不签的后果，我们可以从不同角度进行具体分析：
一、从搬迁主体角度看
（1）政府主导的搬迁项目
当政府为了公共利益，比如进行基础设施建设（像修建公路、铁路等）来推动地区发展时，会严格依据相关法律法规和既定程序开展搬迁工作。
在这种情况下，如果大部分人都已经签署协议并顺利完成搬迁，而少数人拒绝签订协议，政府会根据实际情况依法作出征收补偿决定。
这个决定是在充分考虑各方面因素后作出的，旨在保障公共利益和被搬迁人的合法权益。
若符合法定条件，政府还会向法院申请强制执行，以确保项目能够顺利推进。
（2）商业开发搬迁
对于商业开发性质的搬迁，开发商通常是不能强制被搬迁人搬迁的。
因为商业开发主要是基于市场行为。
若与部分被搬迁人协商不成，开发商可能会选择搁置该地块的开发计划。
这不仅会使开发商的投资和开发进度受到影响，也可能会对整个区域的发展产生一定的阻碍，比如影响周边配套设施的完善等。
二、从被搬迁人角度看
（1）失去优惠和补偿利益
不签协议可能会导致被搬迁人失去一些搬迁带来的优惠政策和补偿利益。
例如，很多搬迁项目会设置搬迁奖励金，鼓励被搬迁人尽早签订协议并完成搬迁，不签协议就无法享受这笔奖励金。
（2）面临后续不便
如果是合法合规的搬迁项目，被搬迁人不配合的话，在后续可能会面临一些不便之处。
比如，由于建设施工，周边环境可能会受到一定影响，如噪音、灰尘等，影响正常生活。

案情回顾:

政府因修建公路进行协议搬迁，大部分居民已签协议，小朱却拒绝签订。政府依法作出征收补偿决定后，小朱仍不配合。同时，某商业开发搬迁中，小李也不签协议，导致开发商搁置开发计划。这引发关于不签协议后果的争议。

案情分析:

1、在政府主导的搬迁中，小朱拒绝签协议，政府作出征收补偿决定是依法保障公共利益和小朱合法权益。若符合条件申请强制执行，也是为推动项目顺利进行。
2、商业开发搬迁里，小李不签协议，开发商搁置计划是因商业开发基于市场行为不能强制搬迁，这会影响开发商及区域发展。
3、从被搬迁人角度，小朱、小李不签协议会失去优惠补偿利益，比如搬迁奖励金。
4、若项目合法合规，不配合的被搬迁人后续可能面临施工带来的噪音、灰尘等不便。