刑事案件中专门管辖指包括军事法院和海事法院、知识产权法院、金融法院等在内的，依据职权范围对专门的刑事案件予以审判的法院。专门管辖是法定管辖的一种，是专门法院与普通法院在审理案件上的一种分工，即确定某类案件归某种专门法院受理。
刑事管辖是指公安机关、检察机关和审判机关等在直接受理刑事案件上的权限划分以及审判机关系统内部在审理第一审刑事案件上的权限划分。依据我国现行刑事诉讼法和诉讼理论，一般将管辖划分为立案管辖和审判管辖；审判管辖又分为普通管辖和专门管辖；普通管辖又进一步划分为级别管辖、地区管辖和指定管辖。这是一套科学的、行之有效的刑事案件管辖体系。
管辖并不是锁定的，还存在优先管辖和移送管辖：
在司法实践中，经常会遇到被告人在几个人民法院的辖区内实施犯罪行为的案件，因而就可能出现几个犯罪地的人民法院都有管辖权的复杂情况，那么，案件究竟应由哪个人民法院审判呢？为了解决这个问题，刑事诉讼法第25条明确规定：几个同级人民法院都有权管辖的案件，由最初受理的人民法院审判。在必要的时候，可以移送主要犯罪地的人民法院审判。对这种案件，法律规定由最初受理的人民法院审判，主要是为了避免人民法院之间发生管辖争议而拖延案件的审判，同时，也由于最初受理的人民法院对案件往往已进行了一些工作，由它进行审判，有利于及时审结案件。但是，为了适应各种案件的复杂情况，法律又规定，在必要的时候，最初受理的人民法院可以将案件移送主要犯罪地的人民法院审判。至于在什么情况下才能认为是“必要的时候”，一般应从是否更有利于发挥审判活动的教育作用等方面来考虑确定。

《人民法院组织法》第十二条人民法院分为：
（一）最高人民法院；
（二）地方各级人民法院；
（三）专门人民法院。