总的来说，拥有房屋产权证书但尚未取得国有土地使用权证书的房屋在面临拆迁之时，其赔偿金额将会全面地结合各种深层次的影响因素进行衡量评估。
其中普遍参照的指标包括了房屋的真实价值、建筑面积以及所处区域的市场行情等多方面要素。
若该等房屋为依法建造并一直处于合法的居住或者商业运营状态下，通常可以获得较为合乎情理的补偿待遇。
然而，具体的补偿标准与方式在不同地域的相关政策及实际情况的影响下，难免会存在些许差异。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十九条
对被征收房屋价值的补偿，不得低于房屋征收决定公告之日被征收房屋类似房地产的市场价格。被征收房屋的价值，由具有相应资质的房地产价格评估机构按照房屋征收评估办法评估确定。
对评估确定的被征收房屋价值有异议的，可以向房地产价格评估机构申请复核评估。对复核结果有异议的，可以向房地产价格评估专家委员会申请鉴定。
房屋征收评估办法由国务院住房城乡建设主管部门制定，制定过程中，应当向社会公开征求意见。