在商铺拆迁的过程中，补偿标准主要依据于宅基地使用权证书或建设用地使用权证书以及国土部门的房屋测绘数据为基础。
合法合理地评估并赔偿商铺房屋价格产生的差额损失、经营期间造成的经济损失、因停业而导致的生产力下降所带来的损失、商铺内地面上的各类固定资产如机械设备等的损失、搬迁过程中所产生的各项费用、以及对解雇员工的安置和补偿费用。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。