农村超占面积的处理是：一、超占部分返还。将多余的宅基地有偿退出交回农村集体组织，或者进行复垦；二、强制拆除。不愿接受处罚的，收回超占宅基地；三、付费有偿使用。接受处罚的，继续付费使用其超占、多占的宅基地。

《农村宅基地管理办法》第九条农村村民一户只能拥有一处宅基地，宅基地面积标准（包括附属用房、庭院用地），使用耕地最高不得超过125平方米；使用其他土地最高不得超过140平方米；山区有条件利用荒地、荒坡的，最高不得超过160平方米。宅基地的用地面积限额为：三人及三人以下的农户75㎡以内，四人的农户100㎡以内，五人的农户110㎡以内；六人及六人以上的农户125㎡以内。使用非耕地的，每档最高可增加15㎡；山区有条件利用荒坡、荒山建房的，每档最高可增加35㎡。实施旧村改造、下山移民拆除面积超出用地限额20㎡以上的，可放宽一个档次的用地限额。