在车辆遭受水淹且保险公司未能给予全损理赔的情况下，车主可以选择如下途径以维护自身权益：
首先，与保险公司展开积极沟通，详细阐述车辆受损状况以及相关需求，恳请保险公司安排对事故车辆进行全面细致的检查和评估；
其次，倘若与保险公司的协商无法达成一致意见，车主还可考虑委托第三方评估机构进行车辆损失鉴定工作，根据鉴定结果再行向保险公司提出全损赔偿请求；
最后，若保险公司仍然坚持不予理赔，车主有权向中国银行保险监督管理委员会进行投诉或者直接向法院提起诉讼。在此过程中，妥善保存相关证据材料显得尤为关键，这将有助于在后续维权行动中提供有力支持。

《保险法》第二十四条保险人依照本法第二十三条的规定作出核定后，对不属于保险责任的，应当自作出核定之日起三日内向被保险人或者受益人发出拒绝赔偿或者拒绝给付保险金通知书，并说明理由。