在行车过程中不幸将马匹撞击致死，保险公司是否会予以理赔，这主要取决于保险合同中的具体规定与事故责任的判定结果。通常来说，如果该车辆已经购买了机动车交通事故责任强制保险以及商业第三者责任保险，并且在事故发生时驾驶员并未涉及到诸如酒后驾车、吸食毒品或者无证驾驶等保险合同所明确规定的免责事项，那么保险公司应当依照保险责任的最高额度，对马匹所有人的财产损失（也就是马匹本身的市场价值）进行赔偿。
然而，值得注意的是，赔偿金额可能会受到保险合同中所规定的财产损失赔偿限额、免赔额以及免赔比率等因素的制约。除此之外，保险公司还可能会要求提供马匹价值的相关证明文件、事故责任认定书等资料。假如马匹的主人对于赔偿金额存在异议，那么双方就有可能需要通过协商、调解甚至诉讼等途径来解决这个问题。总的来说，车辆碰撞导致马匹死亡，保险公司是否理赔以及理赔金额的多少，都必须根据保险合同的条款、事故责任的认定以及相关的证明材料进行全面而深入的分析和评估。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条
被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。
《中华人民共和国保险法》第五十五条
投保人和保险人约定保险标的的保险价值并在合同中载明的，保险标的发生损失时，以约定的保险价值为赔偿计算标准。投保人和保险人未约定保险标的的保险价值的，保险标的发生损失时，以保险事故发生时保险标的的实际价值为赔偿计算标准。
《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条
机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足的部分，按照下列规定承担赔偿责任：
（一）机动车之间发生交通事故的，由有过错的一方承担赔偿责任；双方都有过错的，按照各自过错的比例分担责任。
（二）机动车与非机动车驾驶人、行人之间发生交通事故，非机动车驾驶人、行人没有过错的，由机动车一方承担赔偿责任；有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任；机动车一方没有过错的，承担不超过百分之十的赔偿责任。