申请宅基地纠纷的行政复议，可参照以下清晰步骤进行：
一、确认复议机关
要明确具体的复议机关，通常是作出相关具体行政行为的行政机关的上一级主管部门或者本级人民政府。
例如，若对乡镇政府作出的关于宅基地的处理决定存在异议，那么就可以向县级政府提出行政复议申请。
这一步很关键，找准复议机关是后续流程顺利开展的基础。
二、准备材料
1.行政复议申请书：需详细写明申请人和被申请人的基本信息，包括姓名、地址、联系方式等。
明确阐述复议请求，也就是希望通过复议达到的具体目的。
同时，要如实陈述事实和理由，清晰说明为何认为原行政行为不合理。
2.证据材料：准备能够证明宅基地纠纷相关事实的各类材料，
3.身份证明材料：若申请人是自然人，需提供身份证复印件等有效身份证明。
三、申请期限
应当在知道具体行政行为之日起60日内提出申请，不过，要是法律另有特殊规定，则按照相关法律执行。
注意把握好申请时间，避免逾期影响自身权益。
四、提交申请
把准备齐全的材料提交给复议机关。
提交方式较为灵活，既可以选择当面递交，直接到复议机关办公地点提交材料；也可以通过邮寄的方式，按照规定的地址和要求寄送。
复议机关在收到申请后，会认真进行审查，对于符合条件的申请，将会予以受理，并依照法律规定作出复议决定。

案情回顾:

小朱对乡镇政府作出的宅基地处理决定不满，欲申请行政复议。他不清楚复议机关，也未准备齐全材料，且差点错过60日申请期限。提交申请时，他先选择邮寄但担心材料丢失，又想当面递交，不知如何选择。

案情分析:

1、关于复议机关，小朱应向县级政府提出申请，因为对乡镇政府宅基地处理决定有异议，县级政府是合适的复议机关。
2、准备材料方面，小朱需写好行政复议申请书，详细阐述信息、请求及理由，还应准备好权属证明等证据材料和身份证明材料。
3、申请期限上，小朱应在规定60日内申请，除非有特殊法律规定。
4、提交申请时，当面递交和邮寄均可，小朱可根据自身情况合理选择。