在劳动者未经许可擅离岗位，导致雇主遭受经济损失的情况下，雇主有权依据劳动合同的规定，向该雇员追索经济赔偿。
关于经济赔偿的数额大小，雇主可以通过从劳动者本人当月工资中进行扣除来实现。
然而，必须注意的是，每月从劳动者的工资中所扣除的数额，不得超出其当月薪酬总额的20%。
如果扣除之后所剩下的工资额度仍然不足以达到本地的最低工资标准，那么应按照最低工资标准予以发放。

《工资支付暂行规定》第十六条
因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。