一、证据不足不起诉案底会记录在档案中吗?
证据不足不起诉是不会有案底的，如果人民检察院作出证据不起诉的决定的，人民法院没有作出有罪判决，不会有案底
依据最高人民检察院的《规则》的规定，具有下列情形之一的，不能确定犯罪嫌疑人构成犯罪或需要追究刑事责任的，属于证据不足，不符合起诉条件，可以做出不起诉决定：
(1)据以定罪的证据存在疑问，无法查证属实的;
(2)犯罪构成要件事实缺乏必要的证据予以证明的
(3)据以定罪的证据之间的矛盾不能合理排除的;
(4)根据证据得出的结论具有其他可能性的。
二、不追究刑事责任的情形
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(二)犯罪已过追诉时效期限的;
(三)经特赦令免除刑罚的;
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。
三、不认罪可以定罪吗?
可以的，只有证据就可以定罪。
刑事诉讼法
第五十三条对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚;没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
证据确实、充分，应当符合以下条件：
(一)定罪量刑的事实都有证据证明;
(二)据以定案的证据均经法定程序查证属实;
(三)综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。
证据不足的情况下如果要坚持起诉，这种做法是很有可能放过了真正的犯罪嫌疑人，让现在所谓的犯罪嫌疑人含冤入狱的，相信这种状况不是大家希望看到的。所以，人民检察院作出不起诉的这种决定是唯一的选择，关于案底，只有确认有罪了才会有案底。
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