运管部门对车辆改装通常只针对营运车辆，私家车改装由交警部门认定及处理。实践当中一般有两种认定方法：
1、对照道路运输证正证上的车辆照片和车辆登记尺寸进行认定。通过车辆勘验，对车辆的外廓及内箱长、宽、高进行测量，再对照道路运输证上登记的车辆外廓及内箱尺寸就可以认定是否有改装。一般增加或者减少5CM以内不认定为改装（正常测量误差范围），如果超过5CM则认定为改装；
2、部分车主在车辆未申请道路运输证前就已经对车辆进行改装，之后再去申请道路运输证，就有可能存在虽然有改装情形，但是经过测量尺寸却与道路运输证登记尺寸一致。这时，一般运管部门会对该类车型的标准技术尺寸进行查询，以认定车辆是否有改装。

《机动车登记规定》第十条
已注册登记的机动车有下列情形之一的，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请变更登记：
（一）改变车身颜色的；
（二）更换发动机的；
（三）更换车身或者车架的；
（四）因质量问题更换整车的；
（五）营运机动车改为非营运机动车或者非营运机动车改为营运机动车等使用性质改变的；
（六）机动车所有人的住所迁出或者迁入车辆管理所管辖区域的。
可以向登记地车辆管理所申请变更登记。