犯交通肇事罪检察院不起诉驾驶证会被吊销。
检察院不起诉说明不追究刑事责任，但是还要承担民事赔偿责任及行政处罚。刑事责任的免除不会影响行政处罚的执行，如有违章驾驶行为的，应当由公安机关交通管理部门对驾驶人予以行政处罚，应当吊销驾驶证的，还是应当按照道路交通安全法的规定吊销驾驶证。
法院不起诉的情形有：
(1)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
(2)犯罪已过追诉时效期限的，刑法规定犯罪已过追诉时效期限的不再追诉，主要是因为犯罪分子对社会已无危害，没有必要再对他追究刑事责任。
(3)经特赦令免除刑罚的，特赦是全国人大常委会根据中共中央或国务院的建议，经过审议决定，由最高人民法院和高级人民法院执行。
(4)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或撤回告诉的。
(5)犯罪嫌疑人、被告人死亡的，犯罪嫌疑人、被告人死亡的，意味着失去了追究刑事责任的对象，追究其刑事责任已没有任何实际意义，故刑事诉讼活动没必要继续进行下去，因此，人民检察院应当作出不起诉决定，就此终止刑事诉讼。
(6)其他法律规定免予追究刑事责任的

《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零一条
违反道路交通安全法律、法规的规定，发生重大交通事故，构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
造成交通事故后逃逸的，由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证，且终生不得重新取得机动车驾驶证。