事故处理还是按照正常程序由交警作出责任认定,如果军人在本事故中负事故主要以上责任,那么涉嫌交通肇事罪,需要移交军队有关部门处理,也就是刑事追究方面交由军方司法处理。具体法律依据如下:
《道路交通事故处理程序规定》第七条 军队、武警部队人员、车辆发生道路交通事故的,按照本规定处理。需要对现役军人给予行政处罚或者追究刑事责任的,移送军队、武警部队有关部门。