当发生交通事故且双方承担同等责任时，医药费一般会依照双方的责任比例来进行分摊。
首先，双方的交强险会在其责任限额范围内进行赔付，要是超出了交强险的部分，那就接着按照同等责任的比例来分担。
比如说，总的医药费是10万元，而交强险的医疗费用赔偿限额是1.8万元，这样一来，交强险就会先把1.8万元给赔付了。
之后剩下的8.2万元，因为双方是同等责任，所以各自要承担一半，也就是各自承担4.1万元。
在这个过程中，双方可以通过互相商量来确定具体的赔偿方式以及时间。
要是双方商量不那就可以通过打官司的途径来解决问题。
这里得特别注意，在进行赔偿的时候，一定要把医药费的相关票据之类的证据好好保存起来，这样以后要是需要维护自己的权益，就有凭证。